西安交通大学医学部前身是国立北京医学专门学校,医学部拥有基础医学院、第一临床医学院(第一附属医院)、第二临床医学院(第二附属医院)、口腔医学院(附属口腔医院)、公共卫生学院、药学院、法医学院、护理学系8个教学实体单位;设立转化医学研究院、Med-X研究院、药物科学与技术研究院、生物证据研究院、全球健康研究院、精准医疗研究院等6个研究院;建有实验动物中心、生物医学实验研究中心等教学科研机构。
医学部现有生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、口腔、护理学7个一级学科博士学位授权点,2个博士专业学位授权点;8个一级学科硕士学位授权点,6个硕士专业学位授权点。有6个一级学科博士后科研流动站,拥有4个国家重点学科(生理学、法医学、泌尿外科和皮肤病与性病学),24个国家临床重点专科,2个国家级疑难病症诊治能力提升工程项目(呼吸系统疾病和心脑血管疾病),12个省级重点学科,12个省级优势学科。拥有13门国家级一流本科课程,53门国家、省、校级“精品课程”,3门国家级和省级双语示范课程,5个国家和省级优秀教学团队。临床医学、药理与毒理学、生物与生物化学、神经科学与行为学、分子生物学与遗传学等5个学科进入ESI全球前1%行列。
医学部开设有临床医学(五年制、5+3一体化、侯宗濂医学实验班及留学生)、口腔医学(五年制、留学生)、预防医学(五年制)、法医学(五年制)、基础医学(五年制)、护理学、药学、制药工程、临床药学等专业,临床医学专业获批首批国家级一流专业建设点,口腔医学、法医学、护理学专业获批首批省级一流专业建设点。