南昌大学基础医学院为国家培养了大批基础医学类人才。现有基础医学一级学科博士点1个、一级学科硕士点2个,已形成“神经生物学、肿瘤生物学、干细胞与再生医学、生殖生物学”等多个优势研究方向,相关学科分子生物学和遗传学排名进入ESI前5‰,生物学与生物化学、神经科学与行为学进入ESI前1%。
拥有“教育部实体肿瘤分子靶向医药基础研究创新中心”“江西省肿瘤病原学和分子病理学重点实验室”“肿瘤生物学江西省重点实验室”“江西省生殖生理与病理重点实验室”“江西省高等学校基础医学重点实验室”“脑科学与脑健康江西省重点实验室”“江西省自主神经功能与疾病重点实验室”等省部级重点实验室和平台,以及南昌大学基础医学研究所、南昌大学生物医学研究院、南昌大学司法医学鉴定研究所等校级科研与社会服务平台。