石河子大学农学院以建设一流学科为目标,持续强化基地和团队建设。现有作物学国家一级重点学科,作物学、植物保护学新疆维吾尔自治区重点一级学科,园艺学兵团重点学科;作物学入选自治区高峰学科,植物保护学科入选自治区高原学科。
学院以培养创新性、应用型复合人才为目标,全面推进本科卓越农林人才工程和研究生创新培育工程,现有农学、种子科学与工程、植物保护、农业资源与环境、园艺、设施农业科学与工程、林学、园林等8个本科专业,作物学、植物保护学、园艺学、农业资源与环境4个一级学科硕士点和作物学(涵盖作物高产栽培理论与技术、作物信息技术与精准农业、绿洲生态与农作制度、作物育种的原理与方法、作物生物技术5个2级方向)。