石河子大学医学院始终坚持“立足兵团、服务新疆、面向全国、辐射中亚”的办学定位,把培养适应区域经济社会发展需要的应用型医学人才作为根本任务,坚持以本科教育为主,稳步发展研究生教育,积极推进留学生教育,先后为国家培养各级各类医药卫生技术人才2万余名,为地方和国家医药卫生事业的发展作出了重要贡献。
医学院目前设有临床医学系、基础医学系、护理系、预防医学系、病理学系、口腔医学系、医学检验系、医学影像学系8个系;开设临床医学、护理学、预防医学、口腔医学、医学影像学、医学检验技术6个本科专业,其中临床医学为国家级特色专业,为教育部“卓越医生教育培养计划”-五年制试点单位,临床医学、口腔医学、预防医学、护理学为省级一流专业。