新乡医学院研究生教育覆盖了医学、理学、教育学、法学、管理学、工学、文学等学科门类,形成了以医学为主,多门类、多学科协调发展的学科建设和研究生教育格局。
新乡医学院现有基础医学、临床医学、药学、生物学、心理学、生物医学工程、公共卫生与预防医学、医学技术、马克思主义理论、图书情报与档案管理等一级学科硕士学位授权点,临床医学、公共卫生、护理、公共管理、药学、工程专业学位(生物工程、生物与医药)等专业硕士学位授权点。同时,经教育部批准学校设置了人文医学、职业生涯发展教育交叉学科。我校研究生教育始终坚持教学科研并重,不断凝炼学科方向,科研水平和科技创新能力大幅度提升,形成了神经与精神卫生、肿瘤免疫、组织再生、干细胞工程技术、环境污染与健康等特色鲜明的研究方向。