新疆农业大学机电工程学院拥有“农业工程”一级学科博士学位授权点，“农业工程”一级学科硕士学位授权点，“机械工程”领域工程硕士学位授权点，“农业工程与信息技术”领域农业硕士授权点。学院下设机械科学与工程、农业机械化工程、能源与电气工程三个系，设有农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、新能源科学与工程等4个本科专业。
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