北京工商大学食品与健康学院现有食品科学与工程、食品质量与安全、食品营养与健康、酿酒工程、香料香精技术与工程五个本科专业，其中食品科学与工程、食品质量与安全和酿酒工程三个专业为教育部国家级一流本科专业建设点，食品科学与工程和食品质量与安全两个专业通过中国工程教育专业认证，此外食品科学与工程专业通过IFT、IUFoST国际专业认证。拥有食品科学与工程一级学科博士学位授权点，食品科学与工程、生物与医药一级学科硕士学位授权点，以及食品科学与工程博士后科研流动站。
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