同济大学医学院拥有临床医学一级学科博士、硕士学位授予权;临床医学专业学位博士、硕士学位授予权;基础医学一级学科博士、硕士学位授予权;公共卫生与预防医学、药学、生物医学工程一级学科硕士学位授予权;护理专业学位硕士授予权。
医学院拥有国家临床重点专科(胸外科、消化内科、产科、职业病科、呼吸科、中医科、急诊医学和临床护理专业),和一批上海市重点学(专)科和临床医学中心。