哈尔滨工业大学深圳校区研究生培养充分体现科学性、前瞻性，重视创新性人才的培养，两类方案的侧重点和具体要求不同。学分和培养过程符合校本部统一规定，但课程设置上体现校区特色。强调通识人文和专业课程的有机结合，使深圳在职研究生学生在科学基础、人文素养、专业素质和能力等方面同步提升，全面发展。

　　学术研究型的课程由通识课、人文选修课、基础理论课、专业基础课、专业课、专题课、学术活动组成。应用研究型的课程由通识课、人文选修课、基础理论课、应用基础课、应用技术课、专业课、专题课和实践教学组成。应用研究型强调实践教学与创新能力培养。

　　通识课为必修课，由政治、英语组成。人文选修课除人文素养课程外，还有创业工程学，该课程由学院自行设置、具有深圳特色，旨在帮助在职研究生学生为自行创业做准备。专业基础课、专业课要求跟踪本学科前沿，强调新概念、新思想、新方法。专题课为优秀教授利用国家级、省部级重点实验室等优质资源结合本人研究成果开设的学科前沿讲座。

　　深圳校区鼓励任课教师采用英文授课，学生用英文完成作业、考试及实验报告，教材多为英文原版教材，每门课注明必读的参考书目。每位学生需在导师指导下完成个人培养方案制定。