南通大学在职研究生培养现有基础医学、临床医学两个博士后流动站,基础医学、临床医学、信息与通信工程3个一级学科博士学位授权点,16个一级学科硕士学位授权点,南通大学非全日在研究生5个硕士专业学位授权点。