郑州大学水利科学与工程学院有水利工程和交通运输工程2个河南省一级重点学科。在全国高等学校第四轮学科评估中,水利工程学科被评定为B+,并列第五名,被列为郑州大学一流学科建设序列。设有水利工程博士后科研流动站、水利工程一级学科博士学位授权点,涵盖水工结构工程、水文学及水资源、水利水电工程、水力学与河流动力学、港口海岸与近海工程、工程安全与管理、水利信息技术二级学科博士学位授权点;有水利工程、交通运输工程一级学科硕士学位授权点,10个二级学科硕士学位授权点。
水利科学与工程学院设有水利水电工程、水文与水资源工程、给排水科学与工程、道路桥梁与渡河工程等4个全日制本科专业。