呼伦贝尔学院农学院由原生命科学学院和农林学院组建而成。设有农学、草业科学、生物科学和环境科学本科专业。其中,生物科学专业是内蒙古自治区一流本科专业建设点,环境科学专业是学校首批应用型转型发展试点专业之一。多名专任教师在中国作物学会、中国草学会、内蒙古草学会、内蒙古遗传学会、内蒙古植物学会、内蒙古土壤肥料学会等学术团体担任理事或专业委员会委员。学院为内蒙古草学会理事长单位。
农学院现有内蒙古自治区实验教学示范中心、内蒙古自治区普通生物学“双基合格”实验室、内蒙古自治区生态修复创新平台、呼伦贝尔学院草原生态研究院等教学科研平台;有“乡土草种质资源挖掘与生态修复”“天然草地健康评价与修复”“饲草栽培与加工高效利用”“生态有机肥发酵菌剂研究”“草原生态系统碳汇监测与增汇评价”“呼伦贝尔市生物多样性调查和环境质量评价”“呼伦贝尔草原多营养级互作研究与应用”“大兴安岭林下植物资源研究与利用”“呼伦贝尔草原土壤微生物研究”“作物种质创新及新品种育繁推技术研究与应用”“农牧交错区耕作制度与作物栽培生理生态研究”等科研创新团队。
农学院以培养高素质应用型人才为目标,强化实践教学,依托呼伦贝尔农牧业及区域生态产业优势,与中国农业科学院农业资源与农业区划研究所、内蒙古自治区农牧业科学院、内蒙古农业大学、辉河国家级自然保护区、呼伦贝尔市农牧局、呼伦贝尔市农牧业科学研究所、呼伦贝尔市农牧技术推广中心、呼伦贝尔市草原工作站、呼伦贝尔市远方牧业有限公司、呼伦贝尔恒屹农牧业股份有限公司等多家高校、科研院所、行业企业建立了长期、稳固的产学研基地,彰显了实践教学特色,突出了专业基本功、基本技能的培养特点,人才培养具有鲜明的地方服务特色。