浙江大学生物学博士金谷雷在山东农业大学做了题为“转录组测序实验设计和分析方法”和“关于环境菌群,跟大家谈谈”的在职研究生学术报告。金谷雷先生的此次学术报告会吸引了山东师范大学各学院老师和研究生的参加,这是山东师范大学植物保护学院的第十八场学术报告会。
山东农业大学植物保护学院设有植物病理学系、昆虫学系、农药学系、烟草学系、森林保护学系和菌物资源利用等6个系;设有植物保护学博士后科研流动站,拥有植物保护学一级学科博士点,植物病理学、农业昆虫与害虫防治学、农药学、菌物学、烟草学等5个二级学科博士学位授权点
山东农业大学举办的此次报告会上,金谷雷讲解了大家关心的实验设计的几大问题:重复与混样的利弊、测序方式的优劣、设置对照的要求、取样的注意事项等。让大家通过对各个步骤的把握,取得更为严谨的数据结果。在数据分析流程和软件方面,金老师着重介绍了重测序分析用到的Genesis、seqMonk和作图用到的jvenn等软件,使大家的研究工作如虎添翼。关于环境菌群,金老师主要讲解了微生物菌群的研究和应用现状,及菌群比较的方法,如种类数量比例、样本丰度、Alpha多样性、β多样性等。
金谷雷简介:浙江大学生物信息学博士,杭州谷禾信息技术有限公司总经理,从事生物信息研究12年,参与了包括国家973、863计划以及自然科学基金等项目,独立研发了Biopubinfo知识网络平台,擅长高通量测序数据分析。多项成果发表于PNAS、NEW PHYTOL、PLANT、CELL&ENVIRON、J.EXP.BOT、SCIENTIFIC REPORTS、BMC GENOMICS、J BACTERIOL等国际学术期刊。