中国医学科学院与北京协和医学院实行院校合一的管理体制,自行审核博士学位授权和硕士学位授权的委托学位授予单位。非全日制研究生可分别授予医学博士、理学博士(哲学博士)、医理双博士、工学博士、医学硕士、理学硕士、工学硕士和管理学硕士等学位,授予博士学位人数位居全国医学院校首位。