湖北中医药大学是全国首批招收中医专业研究生的高等院校之一。现有博士学位授权点:含中医学、中药学一级学科博士学位授权点,中医博士专业学位授权点;硕士学位授权点:含中医学、中药学、中西医结合、药学、管理科学与工程和护理学一级学科硕士学位授权点,中医、中药、护理、翻译、药学、医学技术和公共管理硕士专业学位授权点。拥有中医学和中药学一级学科博士后流动站,具有推荐优秀应届本科毕业生免试攻读硕士研究生资格和对港、澳、台地区招收研究生资格。
现有15个国家中医药管理局重点学科,中医学入选湖北省“国内一流学科”培育建设学科;拥有4个省高等学校优势特色学科(群),14个省中医药重点学科;建有5个国家卫生健康委重点专科、9个国家中医药管理局重点专科、21个省级重点专科。临床专科建设成效明显,肝病科、肾病科进入国家区域诊疗中心行列。
建有1个中药资源与中药复方教育部重点实验室,1个老年脑健康中医药防护技术与新产品研发教育部工程研究中心,3个国家中医药管理局三级实验室、重点研究室,1个湖北时珍实验室,1个湖北省中药资源与中药化学重点实验室,3个湖北省工程技术研究中心,1个道地药材与创新中药新产品研发技术创新基地,1个针灸治未病国际合作基地,2个湖北省协同创新中心及其他15个省级、武汉市科研平台。学校是国家中医临床研究基地--中医药防治肝病基地、国家疫病防治及紧急医学救援基地、国家传承创新中心建设单位、国家中医临床教学培训示范中心,国家产业技术创新战略重点培育联盟理事长单位、湖北省中药产业技术创新战略联盟理事长单位、湖北省产业技术创新基地道地药材与创新中药新产品研发技术创新基地的依托单位,是全国中医药标准化技术培训和研究中心、全国中医医院信息管理中心、湖北省中医药继续教育基地。