北京国家会计学院由财政部代管,教学管理依托清华大学。北京国家会计学院在职研究生以注册会计师相关知识为培训内容的,非全日制研究生面向全国的培养宏观经济管理部门、国有大中型企业、金融机构和社会中介机构的高级管理人才及高级财会人才的会计后续教育培训基地。北京国家会计学院在职研究生与清华大学联合培养总会计师方向MBA非全日制研究生,举办会计硕士专业MPAcc非全日制研究生学位教育,为我国宏观经济管理部门、大中型企业以及社会中介机构所培养了大批会计和审计高级专门人才。
北京国家会计学院实行董事会领导下的院长负责制,董事会由财政部、中央组织部、国家发展与改革委员会、国务院国有资产监督管理委员会、商务部、教育部、人事部、中国人民银行、审计署、国家税务总局、中国证监会、中国银监会、北京市人民政府、上海市人民政府、福建省人民政府、厦门市人民政府、上海市财政局、厦门市财政局、清华大学、厦门大学、上海财经大学等组成。董事会主席由财政部部长担任。学院设办公室、教务部、教研中心、信息中心、远程教育中心、总务部等部门。
北京国家会计学院位于北京顺义天竺开发区,占地面积200亩,建筑面积70000平方米,主要设施包括综合教学楼、图书馆及信息中心、会议中心、学员活动中心、体育馆、学员公寓、专家公寓、餐厅等多栋单体建筑,可同时容纳千余名学员培训。学院拥有一流的现代化教学、管理与信息基础设施,建有宽带信息网络系统,提供各种信息环境和多媒体教学环境,提供多种远程教学手段,是一个典型的数字化园区。